-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Expand file tree
/
Copy pathoutput_example.txt
More file actions
13187 lines (13171 loc) · 368 KB
/
output_example.txt
File metadata and controls
13187 lines (13171 loc) · 368 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
Analising fusion: BCAS4::BCAS3
[*] Computing samtools
Gene1: BCAS4
Starting position: 50795124
Max length between read starts: 32
Break from start: 229
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGAGCCTGGGGCCGA***GGTAGGGGACGGGGCTGTGGAGTTGGAGGAGAGGGTTCTCGCGGTTAGGG
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGTGTGCGAGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GCGGGGCGCGCGAGTTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***G
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTA
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTTTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTA
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGACCCTGGGGCCGA***GGGG
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGG
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGG
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGG
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGG
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGG
GGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGCA
GGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTAC
GCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GTGGAC
GCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACC
CGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCT
CGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCT
CGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGGTGT
CGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCT
CGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGCGAAG
CGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCC
GCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTT
GCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTT
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGAGCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGA
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTT
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGAGCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGA
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTT
CGCGAGCTCGCGATCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGACTCTT
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTT
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTT
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTT
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GAGAGAAGA
CGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTT
GCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTG
GCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTG
CGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGA
CGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGA
CGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGA
CGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGA
CCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCG***AGGTACCTTTG
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCCGCGGG
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
GAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGAC
AGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACG
AGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACG
AGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGGTGTTGTGAG
GCTCGCGCTCTTCCGGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGGGTGTTGTGAGG
GCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAG
GCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAG
CTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGG
CTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGG
CTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGG
TCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGA
TCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACGTTTGACAGGA
TCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGA
TCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGA
TCGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGA
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACCGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
CGCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAG
GCGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAGC
CGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAGCG
CGCTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGTACCTTTGACAGGAGCG
CTCTTCCTGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGAC
TCTTCCTGACCCCCGATCCTGAGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACC
TGACCCCCGAGCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACCATCGAG
TGACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACCATCGAG
GACCCCCGAGCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACCATCGAGG
GACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACCATCGAGG
GACCCCCGATCCTGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACCATCGAGG
CCCCCGAGCCGGGGGCCGA***GGCGAAGGAGGTGGAGGAGACCAGCGAGGGC
CCCGATCCTGGGGCCGA***GGTAGGGGACGGGGCTGTGGAGTTGGAGGAGAG
Gene2: BCAS3
Starting position: 61368321
Max length between read starts: 5
Break from start: 186
CCACAG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGCCT
CGCATA***GCCAGGACCACAGGTACCTTTGACAGGAGAGATCGGAAGAGCGG
CGCATA***GCCAGGACCACAGGTACCTTTGACAGGAGAGATCGGAAGAGCGG
CGCATA***GCCAGGACCACAGGTACCTTTGACAGGAGAGATCGGAAGAGCGG
GCCAGG***ACCACAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCCGGAGGTGTG
AGGACC***ACAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGG
CG***AGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTG
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
CC***CGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAG
GG***GCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGA
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
CC***TGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGC
CC***CCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGA
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
GC***CGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGC
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CC***CCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGA
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***GGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
CG***AGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTG
AT***CCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGT
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGAG
TC***TGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGC
CC***TGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGC
TG***GGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGG
CG***AGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTG
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
GG***CCGAGGTACCTTTCACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CC***CCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGA
GG***GGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
GG***GCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGA
CC***GAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCT
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
TG***GGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
CC***GAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCT
GG***GCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGA
CC***CCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGA
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CC***CCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGA
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
CC***GAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCT
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
CC***TGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGC
CC***TGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGC
GG***GGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGG
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CG***ATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGT
AG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGC
AG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGC
AT***CTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTG
TG***GGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGAGTGTGGGAG
GA***GGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGG
CT***GACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCCG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
TC***CTGACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCC
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
AG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGC
AG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGC
TG***ACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGC
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GA***CCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCA
GG***GGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGG
GC***CGAGGTACCTGTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCCGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***GCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGA
CC***CGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***GCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGA
GA***CCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCC
CC***CGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGGCCCTGCTGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
TG***ACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGC
AG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGC
TC***CTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
CC***GAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCA
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CT***GACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CC***GAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCC
CC***CGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAG
TG***ACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGC
TG***ACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGC
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
GA***CCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCT
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
AG***GTACCTCTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGT
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CT***GACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTG
CT***CCCCCGATCCTTGTGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCCGCT
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CT***GGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCG
GG***GGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGG
CC***GAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCG
AG***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGC
AC***CCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTG
GG***CCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAG
CT***CTTCCCGACCCCCGATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTG
CC***GATCCTGGGGCCGAGGTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGCC
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGCC
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGCC
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGAGTTAG
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGGGAGCTGGCC
G***GTACCTTTGACAGGAGCGTGACCCTGCTGGATGTGTGCGGGAGCTGGCC
ALIGNMENTS TO GENE1
Alignments to gene
Read Number 1
***G
***G
Read Number 2
***G
***G
Read Number 3
***G
***G
Read Number 4
***G
***G
Read Number 5
***G
***G
Read Number 6
***G
***G
Read Number 7
***G
***G
Read Number 8
***G
***G
Read Number 9
***G
***G
Read Number 10
***G
***G
Read Number 11
***G
***G
Read Number 12
***G
***G
Read Number 13
***G
***G
Read Number 14
***GGTA
***GGTA
Read Number 15
***GGTA
***GGTA
Read Number 16
***GG--GG
***GGTAGG
Read Number 17
***GG--GG
***GGTAGG
Read Number 18
***GG--GG
***GGTAGG
Read Number 19
***GG--GG
***GGTAGG
Read Number 20
***GG--GG
***GGTAGG
Read Number 21
***GG--GG
***GGTAGG
Read Number 22
***GGCA
***GGTA
Read Number 23
***GGTA
***GGTA
Read Number 24
***G-T-GG--AC
***GGTAGGGGAC
Read Number 25
***GGTA
***GGTA
Read Number 26
***GGTA
***GGTA
Read Number 27
***GGTA
***GGTA
Read Number 28
GGGG-TGT
GGGGCTGT
Read Number 29
***GGTA
***GGTA
Read Number 30
***GG
***GG
Read Number 31
***GGTA
***GGTA
Read Number 32
***GGTA
***GGTA
Read Number 33
***GGTA
***GGTA
Read Number 34
***GGCGAAGG-A
***GGT-AGGGGA
Read Number 35
***GGTA
***GGTA
Read Number 36
***GGCGAAGG-A
***GGT-AGGGGA
Read Number 37
***GGTA
***GGTA
Read Number 38
GGACTCT
GGACCCT
Read Number 39
***GGTA
***GGTA
Read Number 40
***GGTA
***GGTA
Read Number 41
***GGTA
***GGTA
Read Number 42
GAGAGAAGA
GAG-GA-GA
Read Number 43
***GGTA
***GGTA
Read Number 44
***GGTA
***GGTA
Read Number 45
***GGTA
***GGTA
Read Number 46
***GGTA
***GGTA
Read Number 47
***GGTA
***GGTA
Read Number 48
***GGTA
***GGTA
Read Number 49
***GGTA
***GGTA
Read Number 50
***AGGTA
***-GGTA
Read Number 51
***GGTA
***GGTA
Read Number 52
***GGTA
***GGTA
Read Number 53
***GGTA
***GGTA
Read Number 54
***GGTA
***GGTA
Read Number 55
***GGTA
***GGTA
Read Number 56
***GGTACCCG-CGGG
***GGTAGGGGACGGG
Read Number 57
***GGTA
***GGTA
Read Number 58
***GGTA
***GGTA
Read Number 59
***GGTA
***GGTA
Read Number 60
***GGTA
***GGTA
Read Number 61
***GGTA
***GGTA
Read Number 62
GGGG-TGTTGTGAG
GGGGCTGT-G-GAG
Read Number 63
GGTGTTGTGAGG
GGAGTTG-GAGG
Read Number 64
***GGTA
***GGTA
Read Number 65
***GGTA
***GGTA
Read Number 66
***GGTA
***GGTA
Read Number 67
***GGTA
***GGTA
Read Number 68
***GGTA
***GGTA
Read Number 69
***GGTA
***GGTA
Read Number 70
***GGTACGTTTGACAGG
***GGTAGGG--GACGGG
Read Number 71
***GGTA
***GGTA
Read Number 72
***GGTA
***GGTA
Read Number 73
***GGTA
***GGTA
Read Number 74
***GGTA
***GGTA
Read Number 75
***GGTA
***GGTA
Read Number 76
***GGTA
***GGTA
Read Number 77
***GGTA
***GGTA
Read Number 78
***GGTA
***GGTA
Read Number 79
***GGTA
***GGTA
Read Number 80
***GGTA
***GGTA
Read Number 81
***GGTA
***GGTA
Read Number 82
***GGTA
***GGTA
Read Number 83
***GGTA
***GGTA
Read Number 84
***GGTA
***GGTA
Read Number 85
***GGTA
***GGTA
Read Number 86
***GGTA
***GGTA
Read Number 87
***GGTA
***GGTA
Read Number 88
***GGTA
***GGTA
Read Number 89
***GGTA
***GGTA
Read Number 90
***GGTA
***GGTA
Read Number 91
***GGTA
***GGTA
Read Number 92
***GGTA
***GGTA
Read Number 93
***GGTA
***GGTA
Read Number 94
***GGTA
***GGTA
Read Number 95
***GGTA
***GGTA
Read Number 96
***GGTA
***GGTA
Read Number 97
***GGTA
***GGTA
Read Number 98
***GGTA
***GGTA
Read Number 99
***GGTA
***GGTA
Read Number 100
***GGTA
***GGTA
Read Number 101
***GGTA
***GGTA
Read Number 102
***GGTACCTTTGACAGGAGC
***GGTAGGG--GACGGG-GC
Read Number 103
***GGTACCTTTGACAGGAGC-G
***GGTAGGG--GACGGG-GCTG
Read Number 104
***GGTACCTTTGACAGGAGC-G
***GGTAGGG--GACGGG-GCTG
Read Number 105
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 106
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 107
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 108
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 109
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 110
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 111
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 112
GGC-GAAGGAGGTGGAGGAGA
GGCTGT-GGAGTTGGAGGAGA
Read Number 113
***GGTAGGGGACGGGGCTGTGGAGTTGGAGGAGAG
***GGTAGGGGACGGGGCTGTGGAGTTGGAGGAGAG
Aligments to Fusion
Read Number 1
***G
***G
Read Number 2
***G
***G
Read Number 3
***G
***G
Read Number 4
***G
***G
Read Number 5
***G
***G
Read Number 6
***G
***G
Read Number 7
***G
***G
Read Number 8
***G
***G
Read Number 9
***G
***G
Read Number 10
***G
***G
Read Number 11
***G
***G
Read Number 12
***G
***G
Read Number 13
***G
***G
Read Number 14
***GGTA
***G-TA
Read Number 15
***GGTA
***G-TA
Read Number 16
***G
***G
Read Number 17
***G
***G
Read Number 18
***G
***G
Read Number 19
***G
***G
Read Number 20
***G
***G
Read Number 21
***G
***G
Read Number 22
GGCA
GGCA
Read Number 23
***GGTAC
***G-TAC
Read Number 24
***GTGGAC
***GT--AC
Read Number 25
***GGTACC
***G-TACC
Read Number 26
***GGTACCT
***G-TACCT
Read Number 27
***GGTACCT
***G-TACCT
Read Number 28
GG-GGTGT
GGAGGTGT
Read Number 29
***GGTACCT
***G-TACCT
Read Number 30
GGC-GAAG
GGCCGA-G
Read Number 31
***GGTACC
***G-TACC
Read Number 32
***GGTACCTT
***G-TACCTT
Read Number 33
***GGTACCTT
***G-TACCTT
Read Number 34
CGAAGGA
CGGAGGA
Read Number 35
***GGTACCTTT
***G-TACCTTT
Read Number 36
CGAAGGA
CGGAGGA
Read Number 37
***GGTACCTTT
***G-TACCTTT
Read Number 38
GGGAC-TCTT
GGGACGTCGT
Read Number 39
***GGTACCTTT
***G-TACCTTT
Read Number 40
***GGTACCTTT
***G-TACCTTT
Read Number 41
***GGTACCTTT
***G-TACCTTT
Read Number 42
GAGAGAAG
GAG-GAGG
Read Number 43
***GGTACCTTT
***G-TACCTTT
Read Number 44
***GGTACCTTTG
***G-TACCTTTG
Read Number 45
***GGTACCTTTG
***G-TACCTTTG
Read Number 46
***GGTACCTTTGA
***G-TACCTTTGA
Read Number 47
***GGTACCTTTGA
***G-TACCTTTGA
Read Number 48
***GGTACCTTTGA
***G-TACCTTTGA
Read Number 49
***GGTACCTTTGA
***G-TACCTTTGA
Read Number 50
***AGGTACCTTTG
***-G-TACCTTTG
Read Number 51
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 52
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 53
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 54
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 55
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 56
GT-ACCC-GC-GG-G
GTGACCCTGCTGGAG
Read Number 57
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 58
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 59
***GGTACCTTTGAC
***G-TACCTTTGAC
Read Number 60
***GGTACCTTTGAC-G
***G-TACCTTTGACAG
Read Number 61
***GGTACCTTTGAC-G
***G-TACCTTTGACAG
Read Number 62
GG-GGTGTT-GTGAG
GGAGGTGTGCGGGAG
Read Number 63
GG-GGTGTTGTGAGG
GGAGGTGT-GCG-GG
Read Number 64
***GGTACCTTTGACAG
***G-TACCTTTGACAG
Read Number 65
***GGTACCTTTGACAG
***G-TACCTTTGACAG
Read Number 66
***GGTACCTTTGACAGG
***G-TACCTTTGACAGG
Read Number 67
***GGTACCTTTGACAGG
***G-TACCTTTGACAGG
Read Number 68
***GGTACCTTTGACAGG
***G-TACCTTTGACAGG
Read Number 69
***GGTACCTTTGACAGGA
***G-TACCTTTGACAGGA
Read Number 70
***GGTACGTTTGACAGGA
***G-TACCTTTGACAGGA
Read Number 71
***GGTACCTTTGACAGGA
***G-TACCTTTGACAGGA
Read Number 72
***GGTACCTTTGACAGGA
***G-TACCTTTGACAGGA
Read Number 73
***GGTACCTTTGACAGGA
***G-TACCTTTGACAGGA
Read Number 74
***GGTACCTTTGACCGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 75
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 76
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 77
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 78
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 79
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 80
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 81
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 82
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 83
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 84
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 85
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 86
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 87
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 88
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 89
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 90
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 91
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 92
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 93
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 94
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 95
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 96
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 97
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 98
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 99
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 100
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 101
***GGTACCTTTGACAGGAG
***G-TACCTTTGACAGGAG
Read Number 102
***GGTACCTTTGACAGGAGC
***G-TACCTTTGACAGGAGC
Read Number 103
***GGTACCTTTGACAGGAGCG
***G-TACCTTTGACAGGAGCG
Read Number 104
***GGTACCTTTGACAGGAGCG
***G-TACCTTTGACAGGAGCG
Read Number 105
GGAGGTG-GAGGAGA-C
GGAGGTGTGCGG-GAGC
Read Number 106
GGAGGTG-GAGGAGACC
GGAGGTGTGCGG-GAGC
Read Number 107
GGAGGTG-GAGGAGACCAT--C--GAG
GGAGGTGTGCGG-GAGC-TGGCCTGAG
Read Number 108
GGAGGTG-GAGGAGACCAT--C--GAG
GGAGGTGTGCGG-GAGC-TGGCCTGAG
Read Number 109
GGAGGTG-GAGGAGACCAT--C--GAGG
GGAGGTGTGCGG-GAGC-TGGCCTGAGG
Read Number 110
GGAGGTG-GAGGAGACCAT--C--GAGG
GGAGGTGTGCGG-GAGC-TGGCCTGAGG
Read Number 111
GGAGGTG-GAGGAGACCAT--C--GAGG
GGAGGTGTGCGG-GAGC-TGGCCTGAGG
Read Number 112
GGAGGTG-GAGGAGACCAG-C--GAGGGC
GGAGGTGTGCGG-GAGCTGGCCTGAGGGC
Read Number 113
GGA-CGGGGC--TG-TGGAGTTG-GAGGAGAG
GGAGCGTGACCCTGCTGGAGGTGTGCGG-GAG
ALIGNMENTS TO GENE2
Alignments to gene
Read Number 1
ACGC
ACGC
Read Number 2
ACGC
ACGC
Read Number 3
ACGC
ACGC
Read Number 4
GGACCG
GGACCG
Read Number 5
CCAGG
CCAGG
Read Number 6
***-GC
***AGC
Read Number 7
***-GC
***AGC
Read Number 8
***--CC
***AGCC
Read Number 9
***--CC
***AGCC
Read Number 10
***
***
Read Number 11
***
***
Read Number 12
***--CC
***AGCC
Read Number 13
***GG
***AG
Read Number 14
***-GC
***AGC
Read Number 15
***--CC