forked from Shoombuatong/PAAP
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
Expand file tree
/
Copy pathAHTP2132.fasta
More file actions
4264 lines (4264 loc) · 44.8 KB
/
AHTP2132.fasta
File metadata and controls
4264 lines (4264 loc) · 44.8 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
>tetra_pos
AGSP
>tetra_pos
AMQS
>tetra_pos
AWPQ
>tetra_pos
AYFY
>tetra_pos
DERF
>tetra_pos
DWGP
>tetra_pos
EVLP
>tetra_pos
EVPK
>tetra_pos
GKWG
>tetra_pos
GLFG
>tetra_pos
GVGY
>tetra_pos
GWAP
>tetra_pos
HIKW
>tetra_pos
HIRL
>tetra_pos
INQF
>tetra_pos
IVIF
>tetra_pos
IVVE
>tetra_pos
IYLL
>tetra_pos
KIEL
>tetra_pos
LEPP
>tetra_pos
LPLP
>tetra_pos
LPPP
>tetra_pos
LQQQ
>tetra_pos
LSLP
>tetra_pos
PRVF
>tetra_pos
RPLA
>tetra_pos
SNIP
>tetra_pos
VEGY
>tetra_pos
VLGP
>tetra_pos
VVPP
>tetra_pos
VWIS
>tetra_pos
WNPR
>tetra_pos
YGAP
>tetra_pos
YGGY
>tetra_pos
YPYY
>tetra_pos
YQQP
>tetra_pos
YRPY
>tetra_pos
YTVF
>tetra_pos
KWLP
>tetra_pos
AHLL
>tetra_pos
IPAI
>tetra_pos
INSQ
>tetra_pos
HDHM
>tetra_pos
VRSP
>tetra_pos
GMGA
>tetra_pos
ALEP
>tetra_pos
IHPF
>tetra_pos
LSPA
>tetra_pos
FAVP
>tetra_pos
ERVL
>tetra_pos
VWIG
>tetra_pos
VYAP
>tetra_pos
VAND
>tetra_pos
FVAP
>tetra_pos
AGSS
>tetra_pos
YPER
>tetra_pos
AGLP
>tetra_pos
ACHP
>tetra_pos
VFPS
>tetra_pos
LQKW
>tetra_pos
GDAP
>tetra_pos
YPRY
>tetra_pos
TVDQ
>tetra_pos
ITRY
>tetra_pos
IEKP
>tetra_pos
LIQP
>tetra_pos
SQPK
>tetra_pos
GPAM
>tetra_pos
VFER
>tetra_pos
GPPP
>tetra_pos
YNKL
>tetra_pos
GVPK
>tetra_pos
LFRQ
>tetra_pos
AHHP
>tetra_pos
VVRP
>tetra_pos
LQKY
>tetra_pos
YKWL
>tetra_pos
AWPF
>tetra_pos
IYPR
>tetra_pos
IAPG
>tetra_pos
FLPP
>tetra_pos
AIYK
>tetra_pos
LAMA
>tetra_pos
IAIP
>tetra_pos
VRYL
>tetra_pos
KFYG
>tetra_pos
FYQQ
>tetra_pos
LLNP
>tetra_pos
YQAP
>tetra_pos
HPFA
>tetra_pos
TVPY
>tetra_pos
ALPM
>tetra_pos
WYSL
>tetra_pos
FRQF
>tetra_pos
KAFR
>tetra_pos
KEIW
>tetra_pos
KFAR
>tetra_pos
AIPP
>tetra_pos
TYCQ
>tetra_pos
KQMK
>tetra_pos
KTAP
>tetra_pos
VIIF
>tetra_pos
LGGC
>tetra_pos
YEAP
>tetra_pos
LEQL
>tetra_pos
GFHI
>tetra_pos
VPQP
>tetra_pos
LGYL
>tetra_pos
LHLP
>tetra_pos
ALPP
>tetra_pos
LIYP
>tetra_pos
LKPI
>tetra_pos
FDKA
>tetra_pos
LLRF
>tetra_pos
YGLF
>tetra_pos
LPHF
>tetra_pos
PFPE
>tetra_pos
YLLF
>tetra_pos
FFYY
>tetra_pos
VGPR
>tetra_pos
VIKP
>tetra_pos
LQSW
>tetra_pos
YKYY
>tetra_pos
HGLF
>tetra_pos
LSPY
>tetra_pos
LNPA
>tetra_pos
LVYP
>tetra_pos
MDLA
>tetra_pos
LYQA
>tetra_pos
LVRY
>tetra_pos
MFDL
>tetra_pos
NILP
>tetra_pos
VFGR
>tetra_pos
PKHP
>tetra_pos
AHSY
>tetra_pos
PYKW
>tetra_pos
QAFT
>tetra_pos
QPIP
>tetra_pos
QQQG
>tetra_pos
QVVF
>tetra_pos
RALP
>tetra_pos
RPKH
>tetra_pos
LVRT
>tetra_pos
RPYL
>tetra_pos
SLPQ
>tetra_pos
YYRA
>tetra_pos
SPYP
>tetra_pos
VRGP
>tetra_pos
SWSF
>tetra_pos
TAPY
>tetra_pos
TCSP
>tetra_pos
TGVY
>tetra_pos
TQVY
>tetra_neg
INKP
>tetra_neg
FFFA
>tetra_neg
SRGA
>tetra_neg
DALI
>tetra_neg
KVFG
>tetra_neg
ALDV
>tetra_neg
LAGL
>tetra_neg
HRNA
>tetra_neg
CPKC
>tetra_neg
KIEP
>tetra_neg
VNSK
>tetra_neg
NEAK
>tetra_neg
VEFY
>tetra_neg
EREG
>tetra_neg
GWFT
>tetra_neg
LIAG
>tetra_neg
PWSY
>tetra_neg
LEIM
>tetra_neg
SWIL
>tetra_neg
IDLI
>tetra_neg
GFIK
>tetra_neg
HFFT
>tetra_neg
WKGV
>tetra_neg
IFFS
>tetra_neg
NITV
>tetra_neg
GGGP
>tetra_neg
GLVH
>tetra_neg
AAGL
>tetra_neg
WSWF
>tetra_neg
AASS
>tetra_neg
LSKF
>tetra_neg
SIDV
>tetra_neg
PAYL
>tetra_neg
ALIT
>tetra_neg
YHHL
>tetra_neg
HLPN
>tetra_neg
AADA
>tetra_neg
SGMS
>tetra_neg
HVVI
>tetra_neg
LHHR
>tetra_neg
LSPQ
>tetra_neg
TFGM
>tetra_neg
FQGI
>tetra_neg
LLGM
>tetra_neg
KNDS
>tetra_neg
DVVA
>tetra_neg
GFSI
>tetra_neg
RAAK
>tetra_neg
ACTG
>tetra_neg
SIII
>tetra_neg
QKRC
>tetra_neg
NDED
>tetra_neg
CNHS
>tetra_neg
KRKE
>tetra_neg
WRAE
>tetra_neg
NLLL
>tetra_neg
EAMA
>tetra_neg
TQRI
>tetra_neg
LAGS
>tetra_neg
DSFP
>tetra_neg
AVEH
>tetra_neg
AKYA
>tetra_neg
HPMH
>tetra_neg
GDKV
>tetra_neg
GQNY
>tetra_neg
RITS
>tetra_neg
VNAI
>tetra_neg
RYRY
>tetra_neg
IIYI
>tetra_neg
NNPV
>tetra_neg
RPQV
>tetra_neg
QAQP
>tetra_neg
WKDT
>tetra_neg
LPFP
>tetra_neg
FDER
>tetra_neg
VEVL
>tetra_neg
DPAS
>tetra_neg
GTCW
>tetra_neg
KTIT
>tetra_neg
IQNW
>tetra_neg
NEWI
>tetra_neg
GVLW
>tetra_neg
ISGL
>tetra_neg
ALST
>tetra_neg
ANVP
>tetra_neg
TDGS
>tetra_neg
FIFN
>tetra_neg
RMED
>tetra_neg
QLIW
>tetra_neg
GITE
>tetra_neg
ELNT
>tetra_neg
AQAW
>tetra_neg
EEGK
>tetra_neg
MEDV
>tetra_neg
NVVN
>tetra_neg
ELTS
>tetra_neg
FYGT
>tetra_neg
SELF
>tetra_neg
ATQR
>tetra_neg
RSFS
>tetra_neg
LRNS
>tetra_neg
DLIN
>tetra_neg
VGRI
>tetra_neg
EDAL
>tetra_neg
PKKW
>tetra_neg
NTLN
>tetra_neg
EWRM
>tetra_neg
LENQ
>tetra_neg
ALED
>tetra_neg
TYIG
>tetra_neg
DADQ
>tetra_neg
LDIT
>tetra_neg
GAQL
>tetra_neg
YDAR
>tetra_neg
NLNR
>tetra_neg
VAIL
>tetra_neg
MDGI
>tetra_neg
AGTE
>tetra_neg
KIGR
>tetra_neg
LNAQ
>tetra_neg
GRGM
>tetra_neg
AILL
>tetra_neg
GIDV
>tetra_neg
LNAL
>tetra_neg
IAAL
>tetra_neg
RRSV
>tetra_neg
NMGM
>tetra_neg
KKLL
>tetra_neg
ENNV
>tetra_neg
VPEQ
>tetra_neg
NKQI
>tetra_neg
TCEE
>tetra_neg
TWLF
>tetra_neg
SMIS
>tetra_neg
YESL
>tetra_neg
YRPE
>tetra_neg
SHDT
>tetra_neg
KAAM
>tetra_neg
RLGK
>tetra_neg
FIFD
>tetra_neg
NGTV
>tetra_neg
AFRR
>tetra_neg
DEYE
>tetra_neg
FIPS
>tetra_neg
KLEY
>tetra_neg
ALIA
>tetra_neg
LPVT
>tetra_neg
LGLV
>tetra_neg
MEKE
>tetra_neg
VGAT
>tetra_neg
DIRC
>tetra_neg
AGSG
>tetra_neg
DKFL
>penta_pos
AFPRS
>penta_pos
APVPP
>penta_pos
ARPSR
>penta_pos
AVVRP
>penta_pos
AYEES
>penta_pos
AYTQQ
>penta_pos
DIGYY
>penta_pos
EEAGG
>penta_pos
ETNGQ
>penta_pos
FRHEA
>penta_pos
GPSMR
>penta_pos
GTEKC
>penta_pos
GVHHA
>penta_pos
HAEIN
>penta_pos
IAIPP
>penta_pos
IKWGD
>penta_pos
INDPF
>penta_pos
INYWL
>penta_pos
IRAQQ
>penta_pos
IRYCT
>penta_pos
IYPRY
>penta_pos
KDYRL
>penta_pos
LGTQY
>penta_pos
LHEPG
>penta_pos
LHREN
>penta_pos
LKDTQ
>penta_pos
LKPNM
>penta_pos
LKSQQ
>penta_pos
LNECQ
>penta_pos
LQEDG
>penta_pos
LQPHQ
>penta_pos
LQQGG
>penta_pos
LQQQQ
>penta_pos
LRCGG
>penta_pos
LSRGQ
>penta_pos
LSYCG
>penta_pos
LYPVK
>penta_pos
MHYGN
>penta_pos
MNPPK
>penta_pos
MRKDQ
>penta_pos
PLIYP
>penta_pos
PNSHP
>penta_pos
PQPIP
>penta_pos
PTPVP
>penta_pos
PVPQP
>penta_pos
RPKHP
>penta_pos
SLVYP
>penta_pos
SVAKL
>penta_pos
TDVEK
>penta_pos
VDKEA
>penta_pos
VHLAP
>penta_pos
VKETT
>penta_pos
VKKTC
>penta_pos
VLIVP
>penta_pos
VPKVK
>penta_pos
VRMPQ
>penta_pos
VVGAK
>penta_pos
VVYPW
>penta_pos
VYHEL
>penta_pos
VYPHK
>penta_pos
WNINA
>penta_pos
WVPSV
>penta_pos
WYSLA
>penta_pos
YIHPF
>penta_pos
YLEPA
>penta_pos
YPLDL
>penta_pos
YRNTQ
>penta_pos
IHETT
>penta_pos
AYPQQ
>penta_pos
ALPMH
>penta_pos
ARHEI
>penta_pos
VLPEI
>penta_pos
NIIPA
>penta_pos
IRPVQ
>penta_pos
VHLPP
>penta_pos
DLTDY
>penta_pos
DMSVF
>penta_pos
LIWKL
>penta_pos
HPFAQ
>penta_pos
YKWLP
>penta_pos
PQAFP
>penta_pos
IRWCT
>penta_pos
VHYEA
>penta_pos
IKELQ
>penta_pos
GRVMP
>penta_pos
RVPSL
>penta_pos
IQYCA
>penta_pos
ALAFQ
>penta_pos
LQPSS
>penta_pos
PTHIW
>penta_pos
AFPGS
>penta_pos
IEKPP
>penta_pos
ERYPI
>penta_pos
FLVPP
>penta_pos
ASVRT
>penta_pos
IWHHT
>penta_pos
YPGIA
>penta_pos
LHLPS
>penta_pos
RYLGY
>penta_pos
VYLPQ
>penta_pos
ALPHA
>penta_pos
AKSCQ
>penta_pos
LRKKQ
>penta_pos
AEFGS
>penta_pos
PSFQP
>penta_pos
LKDAQ
>penta_pos
AKDQG
>penta_pos
LKELQ
>penta_pos
IYEGY
>penta_pos
LVQGS
>penta_pos
IEWEG
>penta_pos
PAGPR
>penta_pos
YRSTQ
>penta_pos
GVHGV
>penta_pos
VKAGF
>penta_pos
ICRDL
>penta_pos
WHHTF
>penta_pos
VKNEE
>penta_pos
TKVIP
>penta_pos
GVYPH
>penta_pos
KDQDK
>penta_pos
VCYNQ
>penta_pos
LEFNQ
>penta_pos
VRLPT
>penta_pos
HLPLP
>penta_pos
ARPAK
>penta_pos
IQWCA
>penta_pos
HQIYP
>penta_pos
IPAQK
>penta_pos
AMKPW
>penta_pos
FREGD
>penta_pos
FYPEL
>penta_pos
VKHTT
>penta_pos
WNLNA
>penta_pos
VKELQ
>penta_pos
GEGGP
>penta_pos
IGGSI
>penta_pos
DHPFL
>penta_pos
LKPDM
>penta_pos
VKNDT
>penta_pos
MRWRD
>penta_pos
IGKGG
>penta_pos
LYQKS
>penta_pos
ARCRG
>penta_pos
VHRKC
>penta_pos
IGYNQ
>penta_pos
IPAIN
>penta_pos
AVPYP
>penta_pos
TPRVF
>penta_pos
VLPYP
>penta_pos
LALPP
>penta_pos
TRGKQ
>penta_pos
ISSSK
>penta_pos
IRRGQ
>penta_pos
VKELY
>penta_pos
DYVGN
>penta_pos
AKPEG
>penta_pos
ITRTQ
>penta_pos
IDPNG
>penta_pos
ERGDT
>penta_pos
LDIQK
>penta_pos
AKYSY
>penta_pos
LLPPY
>penta_pos
FYTGG
>penta_pos
LYKNG
>penta_pos
FALPC
>penta_pos
DLQGK
>penta_pos
QEVLP
>penta_pos
GCETR
>penta_pos
KPVAL
>penta_pos
AYKRQ
>penta_pos
TKIVP
>penta_pos
WLAHK
>penta_pos
KDERF
>penta_pos
TYLGS
>penta_pos
LELNQ
>penta_pos
TRDQQ
>penta_pos
IEPQG
>penta_pos
KLKFV
>penta_pos
VAWKL
>penta_pos
LPYPY
>penta_pos
HPIKH
>penta_pos
IYSNN
>penta_pos
AYTGV
>penta_pos
APSAK
>penta_pos
LKPMN
>penta_pos
LRQSQ
>penta_pos
VAGTW
>penta_pos
YTAGV
>penta_pos
LLQSW
>penta_pos
VVVPP
>penta_pos
KAPVA
>penta_pos
VLPIP
>penta_pos
IQHST