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COVID19 en Polynésie Française

Agrégation des données brutes sur la situation du COVID19 en Polynésie Française et outils d'import dans OpenSearch.

Contenu du dépôt

  • covid.sc Feuille de calcul sc(1) où les données sont agrégées lorsqu'elles sont publiées;
  • covid-extract.rb Script de conversion de la feuille de calcul vers le format jsonl;
  • insert.sh Script qui lit des lignes au format jsonl (e.g. celles générées par le script ci-dessus) et les insère dans un index OpenSearch créé (et nettoyé) pour l'occasion;
  • import-dashboard.sh Script d'import de dashboards dans OpenSearch-Dashboards (il y en a dans le répertoire dashboards/).

Cas d'usage:

romain@zappy ~/covid-pf % ./covid-extract.rb covid.sc | ./insert.sh

Configuration

Le projet assume qu'OpenSearch est installé sur la même machine avec la configuration par défaut. Pour ajuster cette configuration, créez un fichier local-config.sh où vous pouvez surcharger:

Variable Valeur par défaut
opensearch_protocol https
opensearch_host localhost
opensearch_port 9200
opensearch_curl_args= --insecure --fail --basic --user admin:admin"
opensearch_dashboards_protocol http
opensearch_dashboards_host localhost
opensearch_dashboards_port 5601
opensearch_dashboards_api_curl_args --fail --basic --user admin:admin

Usage

Une fois les données dans OpenSearch, faites ce qui vous plaît, par exemple visualisez les cas actifs avec Timelion:

.es(index=covid,metric=avg:confirmed_case_count).subtract(.es(index=covid,metric=avg:confirmed_case_count,offset="-7d")).points().label("Cas actifs").title("Cas actifs (calculé à partir des cas confirmés)")

Vous êtes invité·e a consulter et contribuer d'autres exemples dans le wiki du projet.

Licence

C'est compliqué :-) Ce projet reproduit des données publiques mises à disposition sans qu'une licence ne leurs soient attribuée. La source est systématiquement indiquée.

Contribution

Il manque des données ? Vous avez repéré un problème ? Merci d'ouvrir une demande de fusion pour apporter les modifications souhaitées en référençant la source de vos données.