R₀ Animation — Panel de propagación de enfermedades

Panel gráfico animado que muestra el número reproductivo básico (R₀) de distintas enfermedades infecciosas, con simulaciones de propagación en una comunidad de 100 personas durante los primeros 10 días después del inicio del brote.

Características

• 19 enfermedades con nombres en español y valores de R₀
• Simulación basada en agentes: 100 puntos que se mueven aleatoriamente y colisionan entre sí
• R₀ por intervalo: cuando hay rango (ej. 12–18), se muestra el intervalo y se usa el punto medio para la simulación
• Colores: Susceptible (gris oscuro) → Infectado (verde) → Recuperado (gris)
• Transmisión por contacto: cuando un susceptible está cerca de un infectado, puede contagiarse según el R₀
• Resultado final: al terminar cada simulación aparece el número total de infectados (acumulado) en grande
• Botón Reiniciar en cada tarjeta para repetir la simulación

Datos

Los datos provienen de la tabla de Wikipedia: Basic reproduction number — "Values of R₀ and herd immunity thresholds (HITs) of contagious diseases prior to intervention".

Cómo usar

1. Abrir directamente: Abre index.html en tu navegador.

2. Con servidor local (recomendado):

   python serve.py

   Se abrirá automáticamente en http://localhost:8765

Generar GIF y video

pip install -r requirements.txt
python generate_gif.py

• GIF: assets/r0_simulation.gif — panel completo con las 19 enfermedades en grid 5×4
• Video MP4: assets/r0_simulation.mp4 — requiere imagenio + ffmpeg (o imageio-ffmpeg)

El GIF incluye:

• Simulación de 10 días en todas las enfermedades
• Panel final con "Infectados tras 10 dias del inicio del brote"
• Cada celda muestra el número total de infectados al final del período
• Créditos con logo de GitHub en la parte inferior derecha

Estructura del proyecto

R0_animation/
├── index.html      # Dashboard interactivo con animaciones
├── data/
│   └── diseases.json   # Datos de enfermedades
├── assets/
│   ├── r0_simulation.gif   # Animación para README
│   └── r0_simulation.mp4   # Video
├── generate_gif.py # Genera GIF y video
├── serve.py       # Servidor HTTP local
├── requirements.txt
└── README.md

Referencia

Inspirado en la visualización del Guardian: Watch how the measles outbreak spreads

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JDConejeros/R0_animation