Hw4 mukhametshina by 1799mrd · Pull Request #29 · Python-BI-2023/HW4_Functions2

1799mrd · 2023-10-11T13:15:16Z

No description provided.

1799mrd · 2023-10-31T08:05:15Z

comment

nvaulin

Привет!
Извини пожалуйста что так поздно проверил работу!

В каком то смысле это тоже реальная сторона программирования. Можешь загуглить то сколько мемов есть про approve my pull request, ахах

Общий комментарий:

В целом хорошая работа, почти везде неплохой код и адекватые идеи функций
Есть какие-то проблемки с локальным качеством типа неймингов - это все старался отмечать
Есть небольшая проблема с ошибим дизайном и логикой. Ты добавила одну отдельную ветку с рандомом и input() от пользователя. Я конечно скажу что этого делать было не нужно, но если ты просто хотела попрактиковаться с таким делом - то тогда это все окей и наоборот здорово! Но к сожалению то как это написано получилось немного сумбурно с высоты птичьего полета. То есть у тебя прям везде копипастом повторяется код, функции делают много не своей работы. Это окей, мы только учимся. Но вот важно отметить. У тебя неплохой кодинг, там буквально что-то довести до идеала. Но к этому надо добавить еще умение видеть общую структуру проекта. Было бы здорово нарисовать условно весь пайплайн на бумажке до того как писать код. Хотя если често я так никогда не делаю. Просто когда готовишь еду или ходишь в душ - шепотом про себя говори вслух историю твоего проекта. Историю в смысле что происходит с данными, то есть идею и логику. И тогда поняв что говоришь одно и то же пару раз, поймешь где можно чуть по другому пересобрать. Потому что когда пишешь код прямо пальцами - в этот момент нет времени смотреть на дизайн.

Если кратко, то у тебя подход такой:

Дело_1
Если условие:
     Дело_2
Если нет:
    Дело_3
Если условие:
     Дело_4, return
Если нет:
     Дело_5
Если условие:
     Дело_6, return
Если нет:
     Дело_7, return

В этом плане это кажется вполне straightforward, но чуть более по-программистки было бы собрать в следующем стиле

Если условие:
     Сделать такую предобработку
Если условие:
     Сделать другую предобработку
Если условие:
     Сделать другую предобработку

Дело_1
Дело_2
return

Надеюсь у меня получилось это как то описать. Если что по коду тоже оставил комментарии.

В любом случае, ты молодец! Очень здорово что ты прям попробовала покопаться и поделать разные штуки. Ридми крутой.

Баллы

README 2.5/2.5
Операции над белками 6/7.5 (из-за повторений кода и того что я писал выше)
За проблемы с неймингами и т п -0.1
За фото команды в README 0.1). Добавил за то что есть, но половину потому что кажется чувак на картинке не принимал участие в этой работе:)

У тебя сдано через полторы недели после дедлайна. Не знаю, у меня хорошее настроение после прочтения этой работы и хочется как то смотивировать тебя присоединятья к нам в поток, поэтому не буду снижать за это баллы. Тем более что сам поздно проверил) Но на будущее не отставай!

Итого: 8.5/10

nvaulin · 2023-11-03T10:49:38Z

@@ -0,0 +1,108 @@
+[![Будто бы полезная ссылка, но просто попытка вставить ссылку_2]<a href="url"><img src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/66/AminoAcidball_rus.svg/1280px-AminoAcidball_rus.svg.png" align="left" height="128" width="198" ></a>](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%B8%D0%BD%D0%BE%D0%BA%D0%B8%D1%81%D0%BB%D0%BE%D1%82%D1%8B)


Хех, правильно! Потом если когда в жизни будешь вставлять ссылки, сможешь прям отсюда и копировать

nvaulin · 2023-11-03T10:50:27Z

+## Table of contents
+
+  * [Project description](#project-description)
+  * [Main part](#Main-part)
+  * [Project description](#project-description) 
+  * [Examples](#examples)
+  * [Contact](#contact)
+  * [Educational result](#Учебный-результат)
+  * [See also](#see-also)


Это супер-здорово, спасибо!

nvaulin · 2023-11-03T10:50:49Z

+## Project description
+ This project was supposed to be carried out in a team, but, unfortunately, I was unable to do only part of this project - all the code and the mini-program were written by me independently. As this HW, I refreshed my memory in working through GitHub, as well as the basic concepts of the Python language. 
+
+![alone](https://sun9-40.userapi.com/impf/c636016/v636016166/239f1/p0AWqN3onLw.jpg?size=550x483&quality=96&sign=19b32adae4a5ac6a436a740160fed9c6&type=album)


😁😁😁

nvaulin · 2023-11-03T10:51:22Z

+## Main part
+Implemented the program `amino_acid_tools.py `. This program necessarily contains the `amino_acid_tools` function, as well as other functions that are described below. The `amino_acid_tools` function accepts an arbitrary number of arguments with a sequence of amino acids or several amino acid sequences (*str*), and it is also possible to introduce the word "random", which generates a random chain of amino acids, in addition, you must enter the name of the procedure to be performed (this is always the last argument, *str*, see usage example). After that, the command performs the specified action on all the transmitted sequences. If one sequence is submitted, a string with the result is returned. If several are submitted, a list of strings is returned.
+
+**Список процедур:**


Внезапно parle france

nvaulin · 2023-11-03T10:52:53Z

+```shell  
+amino_acid_tools('PLfHnfPdD', 'YsGPFEEt', 'ogknHIPTu', 'long_amino_code')   
+```
+Input: 'PLfHnfPdD', 'YsGPFEEt', 'ogknHIPTu', 'long_amino_code'  
+Output: '['ProLeuPheHisAsnPheProAspAsp', 'TyrSerGlyProPheGluGluThr', 'PylGlyLysAsnHisIleProThrSec']'


Во, да, так и надо. Чтобы можно было просто скопипастить и прогнать. Только можно наверное вставить оформление не shell, а python. И строчка и Input в целом тут лишняя, у тебя же в коде как раз input и виден:)

nvaulin · 2023-11-03T19:14:18Z

+        aminoacid_charge = {'R': 1, 'D': -1, 'E': -1, 'K': 1, 'O': 1}
+        charge = 0
+        for aminoacid in amino_sequencqe.upper():
+            if aminoacid in 'RDEKO':


Suggested change

if aminoacid in 'RDEKO':

if aminoacid in aa_charges:

это будет как раз проверка на наличие в ключах

nvaulin · 2023-11-03T19:15:37Z

+            if aminoacid in 'RDEKO':
+                charge += aminoacid_charge[aminoacid]
+        if charge > 0:
+            return 'positiv'


Suggested change

return 'positiv'

return 'positive'

))

А вообще было бы здорово прямо заряд сам и вернуть наверное

nvaulin · 2023-11-03T19:16:25Z

+        for seq in amino_sequence:
+            unique_chars = set(seq)
+            amino_acids = set(amino_acid)
+            if unique_chars <= amino_acids:
+                aminoac_seqs.append(seq)


то есть если пользователь добавил что-то неправильное, то он об этом даже и не узнает?

nvaulin · 2023-11-03T19:22:24Z

+                amino_to_rna (str) or (list): possible RNA sequence
+                amino_seq_charge (str) or (list): "positive", "negative" or "neutral"
+    """
+    *seqs, function = args


Это было актуально в домашке по ДНК/РНК чтобы вы потреннировались с аргументами. Вообще это не очень хорошо, так как по факту сиквенсы и название функции - это разные сущности. А мы их мешаем в одну дырку. Это не хорошо. Есть есть разные штуки - то и принимать их стоит в разные аргументы.

def function(seqs, func):

nvaulin · 2023-11-03T19:22:33Z

+                amino_seq_charge (str) or (list): "positive", "negative" or "neutral"
+    """
+    *seqs, function = args
+    d_of_functions = {'long_amino_code' : long_amino_code,


Suggested change

d_of_functions = {'long_amino_code' : long_amino_code,

functions = {'long_amino_code' : long_amino_code,

1799mrd and others added 6 commits October 11, 2023 14:36

HW4

152faa0

readme file

da78105

final function

fc959e4

Update README.md

fdef8a5

Update README.md

9360c0c

Update README.md

ee856c0

nvaulin reviewed Nov 3, 2023

View reviewed changes

		@@ -0,0 +1,108 @@
		[![Будто бы полезная ссылка, но просто попытка вставить ссылку_2]<a href="url"><img src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/66/AminoAcidball_rus.svg/1280px-AminoAcidball_rus.svg.png" align="left" height="128" width="198" ></a>](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%B8%D0%BD%D0%BE%D0%BA%D0%B8%D1%81%D0%BB%D0%BE%D1%82%D1%8B)

	d_of_functions = {'long_amino_code' : long_amino_code,
	functions = {'long_amino_code' : long_amino_code,

Conversation

1799mrd commented Oct 11, 2023

Uh oh!

1799mrd commented Oct 31, 2023

Uh oh!

nvaulin left a comment

Choose a reason for hiding this comment

Баллы

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Choose a reason for hiding this comment

Uh oh!

Reviewers

Assignees

Labels

Projects

Milestone

Development

Uh oh!

2 participants